Contrôle chimique de la croissance fongique et la production de l’ochratoxine A par des espèces d’Aspergillus carbonarius et d’A. niger agrégats isolées du raisin marocain et exploration de l’activité antifongique des huiles essentielles

Abstract

La contamination des produits agricoles par les champignons phytopathogènes constitue une menace majeure pour le secteur agroalimentaire à l’échelle mondiale. En particulier, les espèces d’Aspergillus qui, outre leur capacité à provoquer la pourriture, menacent la santé humaine et animale notamment par la production des mycotoxines. Parmi ces mycotoxines, l’ochratoxine A (OTA), métabolite secondaire de certaines espèces d’Aspergillus et de Penicillium, est produite sur une large gamme de denrées alimentaires et de produits agricoles. Sa persistance dans les aliments après les étapes de transformation et de stérilisation provoque plusieurs effets délétères comme les effets néphrotoxiques, cancérigènes et tératogènes. Dans ce cadre, l’évaluation de l’effet combiné de trois fongicides (azoxystrobine, hexaconazole et pyriméthanil) et de l’activité de l’eau (0.90 ; 0.95 et 0.99 aw) sur la croissance radiale et la production de l’OTA par cinq souches d’Aspergillus carbonarius et A. niger, isolées à partir du raisin, a été réalisée. L’effet in vitro et in vivo des huiles essentielles (HE) sur la croissance radiale et la production de l’OTA par treize souches d’A. carbonarius et A. niger agrégats ainsi que l’effet de ces huiles sur l’expression des gènes responsables de la biosynthèse de l’OTA chez deux souches d’A. carbonarius et A. niger ont également été étudiés. Les résultats de l’effet des fongicides et de l’activité de l’eau sur la croissance fongique ont montré que tous les fongicides testés réduisent la croissance fongique mais cette réduction dépend de manière très significative (p=0.000) de la souche, de l’activité de l’eau, du fongicide et de la dose appliquée. L’interaction des fongicides et des activités de l’eau affectait aussi bien les phases de latence que les taux de croissance radiale de toutes les souches testées. Le pyriméthanil et l’hexaconazole se sont avérés les plus efficaces, quelles que soient l’activité de l’eau et la dose appliquée avec une inhibition totale de la croissance des cinq souches, à l’exception de la dose la plus faible d’hexaconazole (0.01×DR) à 0.99 aw où une faible croissance a été notée pour A. niger (2.67 mm/jour). La réduction de la croissance fongique pour les trois fongicides était accompagnée par une réduction de la production de l’OTA. L’étude de l’efficacité in vitro et in vivo des huiles essentielles du romarin, du clou de girofle et du thym sur le contrôle de la croissance fongique et la production d’OTA par A. carbonarius et A. niger agrégats a révélé que l’activité antifongique de l’huiles essentielle du romarin (Rosmarinus officinalis) était faible avec des taux d’inhibition qui ne dépassent pas 41.20% à 200 μL/L d’HE. A l’inverse, les huiles essentielles du clou de girofle (Syzygium aromaticum) et du thym (Thymus satureioides) ont une activité antifongique importante avec des taux d’inhibition qui varient selon la souche et la dose de l’HE et atteignent 100% à 200 μL/L. Cependant, cette réduction de croissance était accompagnée dans certains cas par une stimulation de la biosynthèse de l’OTA. En effet, l’étude de l’effet des HE du clou de girofle et du thym sur les niveaux d’expression des gènes impliqués dans la biosynthèse de l’OTA (PKS, NRPS et HAL) chez A. carbonarius et A. niger a révélé que les gènes étudiés ont été surexprimé dans la majorité des traitements. Cette surexpression peut expliquer la stimulation de l’OTA. L’étude in vivo de l’HE du thym et du clou de girofle a montré que ces huiles étaient capables d’une part, de réduire le pourcentage de contamination (RGB%) chez les raisins infectés, et d’autre part, de préserver l’indice d’anthocyane (AriIdx) à la dose la plus élevée (2000 μL/L).