Etude de l'antibioréistance et analyse moléculaire de l'ADN plasmidique des couches d'Escherichia coli responsables de la colibacillose aviaire

Abstract

Quatre vint souches d’Escherichia coli des cas de colibacillose aviaire et provenant de différentes fermes d’élevage de poulets de chair ont été testées pour leurs résistances à 16 antibactériennes. Les fréquences de résistance aux antibactériens sont très élevées avec une tendance nette à la multirésistance. Ces couches ont fait l’objet d’une extraction de plasmides par la technique de lyse alcaline. L’électrophorèse sur gel d’agarose des plasmides natifs puis digérés par les enzymes EcoRI, BamHI et HindIII a montré l’existence d’une grande diversité plasmidiale. Cette richesse plasmidiale peut justifier la multirésistance développée par ces souches. Les hybridations moléculaires réalisés avec le sonde pBR328, les sondes d’ADN ribosomiques (18S, 5S), et avec une sonde d’ADN plasmidique (2Kb) extraite de l’une de ces souches ont confirmé la diversité génétique révélée par les profils restrictifs, bien que ces sondes se sont hybridées avec tous les plasmides hébergées par ces souches, indiquant la présence d’homologie de séquence entre ces plasmides. Par ailleurs, ces sondes se sont hybridées avec l’ADN chromosomique de certaines souches, en l’occurrence avec celui des souches multirésistantes et ne contenant pas de plasmides. Ceci suggère la présence de gène de résistance sur le chromosome bactérien. L’analyse des résultats a montré que le marquage épidémiologique ne peut être uniquement basé sur les profils plasmides. Cette analyse a également mis en évidence l’absence de relation entre les séquences de résistance, les profils plasmidiques, et la répartition géographique des souches d’E. coli aviaires.