DIAGNOSTIC DE LA TUBERCULOSE GANGLIONNAIRE ET PLEURALE PAR LE TEST XPERT A PARTIR DES PRELEVEMENTS FIXES ET INCLUS EN PARAFFINE

Abstract

Le diagnostic de la TEP est parfois difficile en raison du caractère paucibacillaire des lésions. L’introduction des outils de biologie moléculaire, en particulier le test GeneXpert, a considérablement amélioré le diagnostic. Ce test est recommandé pour les échantillons frais. Toutefois, dans la pratique, les biopsies sont uniquement envoyées pour étude histologique, limitant l’accès au matériel frais pour les analyses microbiologiques. Les tissus FFPE deviennent une alternative précieuse, surtout pour les investigations rétrospectives. Notre étude vise à évaluer la performance du test GeneXpert dans le diagnostic de la tuberculose ganglionnaire et pleurale à partir de tissus FFPE, en le comparant aux données histologiques considérées ici comme référence. Un total de 101 échantillons FFPE (ganglionnaires et pleuraux) ont été inclus. La procédure a comporté les étapes suivantes : déparaffinage, digestion protéolytique, et traitement avec le réactif du système GeneXpert. Globalement, la sensibilité du test était de 56,25 % et la spécificité de 86,5 %. Pour les tissus ganglionnaires, la sensibilité du test était de 61,3 %, la spécificité de 75 %, la valeur prédictive positive (VPP) de 82,6 % et la valeur prédictive négative (VPN) de 61,3 %. Pour les tissus pleuraux, la sensibilité chutait à 45,9 %, avec une spécificité de 90 %, une VPP de 94,4 %, mais une VPN faible à 31 %. L’utilisation de tissus FFPE présente plusieurs avantages, ils sont non infectieux, disponibles dans les laboratoires d’anatomie pathologique, permettent des analyses rétrospectives. Cependant, la fixation au formol et l’inclusion en paraffine dégradent l’ADN, compliquant les analyses moléculaires. Il est enfin indispensable de sensibiliser les prescripteurs à l’intérêt d’adresser systématiquement les biopsies à la bactériologie, pour le test Xpert et la culture demeurant le gold standard du diagnostic. Néanmoins, les tissus FFPE représentent une ressource complémentaire précieuse, surtout en cas d’échec de la culture ou d’indisponibilité d’échantillons frais.