Analyse génomique du SARS-CoV-2 au Maroc & Identification des biomarqueurs du cancer de sein chez des patientes Ghanéennes

Abstract

Cette étude comprend deux initiatives de recherche génomique qui soulignent l'importance cruciale du séquençage de nouvelle génération (NGS) et de la bioinformatique. La première étude s'est concentrée sur la surveillance génomique du SARS-CoV-2 au Maroc de 2022 à 2023, utilisant la technologie Ion Torrent pour séquencer des échantillons viraux et détecter les variants circulants au Maroc. Nous avons constaté que les variants Omicron et Delta étaient présents durant cette période, ce qui impacte la transmissibilité, l'efficacité des vaccins et la gravité de la maladie. Des graphiques de distribution des variants et un arbre phylogénétique ont été générés pour fournir des informations détaillées sur le paysage génomique du pathogène.

Le second projet visait à caractériser les mutations associées au cancer du sein dans la population ghanéenne en utilisant des données de séquençage de l'exome complet. Des mutations significatives ont été identifiées dans des gènes clés, y compris BRCA1, BARD1 et TP53. L'application d'outils bioinformatiques a permis une détection à haute résolution et une analyse complète des altérations génétiques à travers différents types d'échantillons. Ces résultats soulignent l'importance d'incorporer ces gènes dans les panels de tests génétiques pour une détection précoce et des stratégies de traitement personnalisées.