EPIDEMIOLOGIE DES VIRUS RESPIRATOIRES A L'HOPITAL MILITAIRE D'INSTRUCTION MOHAMMED V DE RABAT (2019 ' 2023)

Abstract

Les infections respiratoires virales aigûes constituent une cause importante de morbimortalité. L'avènement des techniques moléculaires multiplexes permettant d'identifier simultanément de nombreux agents pathogènes a permis d'optimiser la prise en charge des patients mais également de mieux appréhender l'épidémiologie des virus respiratoires. L'objectif de ce travail a été d'étudier l'épidémiologie des virus respiratoires à l'Hôpital Militaire d'Instruction Mohammed V (HMIMV) et l'impact de la pandémie SARS-CoV-2 sur la circulation de ces virus. Il s'agit d'une étude rétrospective de type descriptive réalisée au laboratoire de Virologie de l'HMIMV de Rabat, étalée sur une période de 44 mois (de Septembre 2019 à Avril 2023). Elle a inclus tous les patients admis pour une infection respiratoire aigue avec une PCR SARS-CoV-2 négative et ayant eu un test PCR respiratoire multiplexe par le kit BioFire{AF} Respiratory 2.1 sur un prélèvement naso/oro-pharyngé. Sur 1050 PCR réalisées, Le taux de positivité était de 38 % (564 patients). L'âge médian des patients avec une PCR positive était de 31 ans (1-91 ans) avec une prédominance des adultes (59%). Le sex-ratio H/F était de 1.52. Parmi les virus détectés, le Rhinovirus était le plus retrouvé (218 patients, 38 %) suivi par le VRS (64 patients, 11 %). Le taux de positivité était le plus bas durant l'hiver 2021, en rapport avec les mesures barrières instaurées au début de la pandémie. Par ailleurs, le Rhinovirus a circulé de manière importante durant toute la période de l'étude ce qui n'est pas le cas pour la grippe. D'après les résultats de notre étude, il est recommandé de commencer par une recherche systématique du Rhinovirus/virus de la grippe chez l'adulte et du VRS/Rhinovirus chez l'enfant. En cas de négativité, une forme grave ou un patient avec des facteurs de risque, un test multiplex peut être réalisé