INFECTION URINAIRE ET PATHOGENES EMERGENTS

Abstract

Les infections du tractus urinaire (ITU) sont la cause la plus importante d'infections bactériennes de nos jours avec une incidence annuelle globale aux alentours de 250 millions de cas. Pour mémoire, environ 50% des femmes auront un épisode d'ITU dans leur vie. L'étiologie de ces infections a largement été étudiée durant les dernières décennies et seules quelques espèces bactériennes sont considérées comme étant de réels uropathogènes (ex. Escherichia coli, Proteus mirabilis, Staphylococcus saprophyticus '). Cependant, l'avènement des nouvelles techniques d'identifications bactériennes et leurs applications de plus en plus importantes et accessibles, comme la spectrométrie de masse MALDI-TOF, ou encore l'utilisation de plus en plus aisée du séquen{D0}cage entier de génomes, de nombreuses espèces bactériennes préalablement considérées comme des contaminants ou comme appartenant à la flore, sont désormais retrouvées dans les échantillons d'urines, identifiées et étudiées. C'est ainsi que de nouvelles espèces uropathogènes ont émergé, comme Actinotignum (anciennement Actinobaculum) schaalii, Aerococcus urinae, Aerococcus sanguinicola ou encore Alloscardovia omnicolens. Ces espèces sont souvent peu étudiées et peu connues par la plupart des bactériologistes et des cliniciens alors que leurs prévalences dans les ITU peuvent être non négligeables chez les patients âgés, en cas de prédispositions urologiques ou de certaines comorbidités. Ce travail a pour but d'éclaircir les connaissances de la communauté médicale concernant ces nouveaux germes uropathogènes émergents, afin d'éviter une prise en charge diagnostique et thérapeutique inappropriée.