Analyse de données transcriptomiques pour la recherche de biomarqueurs liés à certaines pathologies cancéreuses

Abstract

Les travaux de recherche présentés dans ce mémoire concernent l’analyse de données des puces à ADN. Ce domaine est largement abordé dans la littérature, et les applications sont de plus en plus nombreuses et diversifiées. Dans cette thèse, nous nous intéressons particulièrement à la partie d’analyse des données issues de ces Puces à ADN. Durant cette thèse on a réalisé quatre publications : La première concerne l’implémentation de l’algorithme de sélection SAM dans la Boîte à Outils Bioinformatiques Matlab, la deuxième concerne une analyse comparative des méthodes de sélection de gènes , la troisième publication est consacrée au développement d’une approche de sélection de gènes issus de données des puces basée sur le calcul du bruit de fond liés aux expériences répliquées et la dernière est dédiée à la sélection des gènes candidats liés au Cancer de la Prostate. Ces travaux de recherche donnent des résultats très intéressants et ouvrent de nouvelles perspectives au niveau d’utilisation et le développement des outils liés à la technologie des puces à ADN et aussi pour comprendre les mécanismes moléculaires en corrélation avec certaines pathologies notamment le Cancer.