NEMATODES PHYTOPARASITES DES AGRUMES AU MAROC : IDENTIFICATION, DISTRIBUTION ET LUTTE BIOLOGIQUE CONTRE TYLENCHULUS SEMIPENETRANS

Abstract

La filière des agrumes, dont les exportations s’élèvent à 480 millions de dollars, est un secteur stratégique pour l’équilibre de la balance commercial marocaine. Cependant, depuis quelques années, ce secteur est confronté à plusieurs contraintes biotiques et abiotiques limitant sérieusement son potentiel de production. Parmi ces contraintes, les plus menaçants sont les nématodes phytoparasites (NPP) qui peuvent causer des pertes de rendement de 10 à 30%. La gestion des NPP s’appuie largement sur l’utilisation des nématicides chimiques, dangereux pour l’homme et l’environnement. Leur action éphémère et leur impact sur les coûts de production rendent nécessaire la recherche d’alternatives durables. L’objectif principal de cette thèse est double. Le 1er consiste à étudier la répartition géographique des NPP dans les cinq principales régions agrumicoles nationales, et leur dynamique en fonction des saisons et des conditions agronomiques. Le 2 ème objectif porte sur la recherche d’outils biologiques pour lutter contre le nématode T. semipenetrans. Il s’agit de : 1) sélectionner les porte-greffes résistants à ce nématode, 2) explorer le potentiel nématicide du microbiome rhizosphérique (bactéries, champignons, CMA) des agrumes, et 3) évaluer la toxicité de certaines plantes aromatiques et médicinales contre T. semipenetrans. Vingt-et-un genres et dix espèces de NPP ont été recensés dans les matrices du sol et racines des agrumes dont Tylenchulus semipenetrans (100%), Helicotylenchus spp. (62,5%) et Pratylenchus spp. (66,7%) sont les plus prévalent. La diversité des NPP est plus importante au niveau des régions de Marrakech-Safi, Beni Mellal-Khenifra et Gharb qu’au niveau de Berkane et Souss-Massa. Les NPP sont plus abondants au printemps au niveau du domaine Graoua, suivi par le domaine Benkebboura et d'Arsat Moulay Abdeslam. T. semipenetrans, Helicotylenchus spp. et Xiphinema spp. ont été rencontrés pendant toutes les saisons et dans les trois sites. T. semipenetrans a été le plus prévalent, en particulier au printemps. Une corrélation étroite a été relevée entre la dynamique des NPP, les saisons et les propriétés du sol. Le Citrange carrizo a montré une forte résistance à l’infestation et à la reproduction de T. semipenetrans, tandis que le Citrange troyer, le Citrange C-35 et le Citrus macrophylla ont présenté une tolérance modérée. En revanche, le Bigaradier, le Bigaradier Australian et le Citrus volkameriana se sont avérés être les plus sensibles à ce nématode. La caractérisation microbiologique du sol rhizosphériques et des racines des agrumes a permis d'isoler une centaine de micro-organismes parmi lesquels, 10 antagonistes (5 bactéries, 3 champignons et 2 CMA) ont été sélectionnés grâce à leurs pouvoirs nematicides contre T. semipenetrans : Variovorax paradoxus (OQ651063), Bacillus pseudomycoides (OQ652044), Bacillus simplex (OQ651985), Bacillus cereus (OQ651999), Paracoccus speluncae (OQ652010), Paecilomyces lilacinus , Aspergillus ustus (OR250163), Aspergillus terreus (OR250916), Funneliformis mosseae, and Rhizophagus irregularis En outre, parmi les sept espèces de plantes aromatiques et médicinales testées, Rosmarinus officinalis et Thymus vulgaris ont montré l’efficacité nématicide la plus importante avec une forte toxicité contre T. semipenetrans. Ces outils biologiques pourraient servir à l’élaboration de nouveaux bionématicides efficaces contre ce nématode, tout en stimulant la croissance des agrumes.