caracterisation génétique et moléculaire du pommier au Maroc et de son ravageur le puceron cendré

Abstract

En vue de fournir des éléments d’aide pour la gestion et la valorisation du germplasme de pommier (Malus domestica) au Maroc, la présente thèse a eu pour objectif d’évaluer la diversité phénotypique, chimique et génétique des cultivars de cette espèce, ainsi que l’étude de la diversité génétique de l’un de ses principaux ravageurs, Dysaphis plantaginea. L’évaluation de la diversité phénotypique de 30 cultivars à l’aide de 34 marqueurs pomologiques et chimiques a permis de révéler trois groupes de cultivars, différenciés sur la base de plusieurs marqueurs dont les plus discriminants sont la taille, le poids, la forme et la couleur du fruit, la longueur du pédoncule, la surface de liège autour du pédoncule, l’acidité titrable et la teneur en solides solubles (Brix°). La diversité génétique de 29 génotypes (4 variétés introduites et 25 cultivars locaux) provenant de 4 régions (Marrakech, Azilal, Khénifra, Fès) a été estimée à l’aide de 15 marqueurs ISSR. Les résultats obtenus ont révélé une diversité génétique relativement élevée des cultivars étudiés qui sont différenciés dépendamment de leur origine géographique. D’autre part, les analyses des résultats ont également révélé des cas possibles de synonymie et d'homonymie chez les cultivars étudiés. L’exploitation de 26 marqueurs SSR chez 27 génotypes locaux montre que seuls dix marqueurs sont capables de résumer l’ensemble des informations génétiques détectées par les 26 marqueurs étudiés. L’analyse des résultats obtenus a également révélé deux cas de duplication, trois cas possibles d'homonymie et 13 liens de parenté au sein des génotypes étudiés. La dernière partie de ce travail a concerné une étude de la diversité génétique des populations de puceron cendré (D. plantaginea) récoltées des principales zones de production du pommier au Maroc à l’aide de 30 marqueurs SSR. L’analyse des fréquences alléliques a révélé une diversité génétique relativement faible des populations étudiées. La majeure partie de cette diversité (97.29%) se trouve au niveau intra-population. En outre, de faibles différenciations génétiques entre les populations (Fst =0.027) avec un flux génétique élevé (Nm = 4.80) ont été trouvées. Ces résultats nous laissent suggérer que les populations de ce ravageur au Maroc, sont relativement homogènes. Cette homogénéité peut ouvrir de nouvelles perspectives dans les méthodes de lutte contre ce ravageur. Les résultats obtenus au cours de cette thèse fournissent des informations cruciales sur la composition génétique et les caractéristiques phénotypiques du pommier à travers le Maroc, ainsi que sur la diversité génétique d'un des pucerons les plus nuisibles de cet arbre fruitier d'importance agronomique