ÉVALUATION DE LA PCR MULTIPLEX FILMARRAY GASTROINTESTINAL PANEL PAR RAPPORT À LA COPROCULTURE POUR LA DÉTECTION DES AGENTS BACTÉRIENS DANS LES GASTROENTÉRITES

Abstract

Introduction/Objectifs : La gastro-entérite infectieuse constitue une cause majeure de morbidité et de mortalité. La coproculture reste la méthode diagnostique standard, tandis que de nouvelles techniques moléculaires, telles que la PCR multiplex, ont été mises en place comme techniques de diagnostic rapide. Le but de cette étude est de mettre en évidence l'intérêt de la PCR multiplex dans le diagnostic des infections gastro-intestinales bactériennes, en la comparant à la coproculture. Matériels et méthodes : Il s'agit d'une étude rétrospective à visée descriptive réalisée au CHU Ibn Sina de Rabat. Elle inclut tous les patients hospitalisés dans les différents services du centre hospitalier, ayant bénéficié d'une PCR gastro-intestinale et d'une coproculture négative durant la période d'étude. Cette étude s'étend sur une période de 15 mois, allant de début janvier 2022 à fin mars 2023. Résultats : L'étude a inclus 48 patients hospitalisés, âgés de 1 mois à 66 ans, avec une médiane d'âge de 21,5, dont 79,2% était des enfants. Une prédominance masculine a été notée (64,6%) avec un sex-ratio H/F de 1,82. Le panel FilmArray GI a détecté au moins un pathogène dans 27 échantillons, soit un taux de positivité de 56,25%. E.coli enteroaggregative (EAEC) et E.coli entéropathogène (EPEC) étaient les bactéries les plus fréquemment détectées, avec des taux de positivité de 33,3% et 29,2% respectivement. Les résultats positifs obtenus par la PCR multiplex FilmArray GI étaient fortement corrélés à la présence de selles diarrhéiques, ainsi qu'à la détection de leucocytes et d'hématies dans les échantillons de selles, avec des valeurs p respectives de 0,003, 0,006 et 0,014. Conclusion : Le FilmArray Gastrointestinal Panel a montré une très bonne performance diagnostique par rapport à la culture pour le diagnostic de la gastroentérite bactérienne.