Etude du polymorphisme des motifs de phosphorylation « EPIYA » de l’ Helicobacter pylori , de la variabilité génétique de la région intermédiaire du vacA et leur association avec les différentes pathologies gastriques

Abstract

L’infection à H. pylori provoque une gastrite chez tous les patients infectés. Cette dernière peut évoluer vers des pathologies sévères telles que l’ulcère gastroduodénal et le cancer gastrique. L’évolution de l’infection vers l'une ou l'autre de ces pathologies dépend essentiellement du génotype bactérien, notamment le cagA et le vacA. Au Maroc, malgré un taux élevé d’infection à H. pylori, aucune étude n'a été réalisée pour déterminer l’impact du polymorphisme de ces génes sur l’évolution de l’infection. L’objectif de ce travail est donc d’étudier la diversité génétique de ces deux gènes et spécifiquement de la région intermédiaire de vacAi et la région variable 3’ de cagA et d’établir les associations " génotypes-pathologies" et "génotypes-lésions histologiques" afin de determiner les éventuels marqueurs prédictifs de l’évolution de l’infection. Ainsi, 1353 patientsconsentants et chez qui une endoscopie digestive a été préscrite ont été recrutés au service des explorations fonctionnelles du CHU Hassan II de Fès. Après recueil des informations relatives aux différents facteurs pouvant être liés à l’infection à H. pylori, des biopsies gastriques ont été recueillies lors de la fibroscopie. Ces biopsies ont été utilisées pour l’examen anatomo-pathologique et la détection moléculaire de H. pylori. Ensuite, le profil génotypique a été déterminé à partir des biopsies H. pylori positives. Ainsi, le statut cagA et le génotypage de vacA (s, m et i) ont été déterminés par PCR. L’étude du type et du nombre de répétitions du motif « EPIYA » a aussi été réalisée directement sur les biopsies présentant un cagA positif. Une analyse statistique a été réalisée afin d'étudier la corrélation entre les génotypes et les différentes variables. Sur l'ensemble des biopsies, le taux d'infection a été déterminé et est de 61,1%. Le gène cagA a été amplifié dans 68,9% des cas et l’analyse de la région 3’cagA a montré la présence exclusive du type « western cagA » avec une prédominance du motif EPIYA–ABC (71,4%). Le nombre de répétitions du motif EPIYA-C varie de 0 à 2. Cependant, le gène vacA a été amplifié dans 99,39% des cas et les allèles vacAs2, vacAi2 et vacAm2 sont les plus prédominants. L’analyse multivariée montre que : i) Le génotype vacAs1 est plus associé à l’UG (OR = 3,38 ; IC : 1,96-5,82) et à l’UD (OR = 2,56 ; IC : 1,60-4,07) ; ii) Les patients infectés par des souches portant le génotype vacAi1 ont 3,28 fois plus de risque de développer le CG par rapport aux patients ayant une Gs et infectés par vacAi2 (OR = 3,28 ; IC : 1,41 – 7,62). Ce résultat est confirmé par l'association de vacAi1 avec les lésions précancéreuses (MI+D) (OR = 3,16 ; IC : 1,85 – 5,41); iii) L’infection par des souches d’H. pylori ayant deux motifs EPIYA-C est un facteur augmentant à 13 fois et 6 fois le risque de développer un CG comparés aux cas de Gs (OR = 13,02 ; IC : 2,60-65,16) et d’UD (OR = 6 ; IC : 1,29-27,76) ayant des souches dépourvues de ce motif, respectivement. Les résultats de cette étude suggèrent que le génotype vacAi1 et le nombre de motifs EPIYA-C de cagA peuvent être d'une utilité clinique et utilisés comme marqueurs prédictifs de l'évolution de l'infection. Ceci permettra d'identifier les patients présentant un risque élevé de développer un GC et qui nécessitent une attention et un suivi particuliers.